1.樣品處理(樣本處理區(qū))1.1樣本前處理
每份組織分別從3個不同的位置稱取樣品約1g,手術(shù)剪剪碎混勻后取0.5g于研磨器中研磨,加入1.5mL生理鹽水后繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至1.5mL滅菌離心管中,8000rpm 離心2min,取上清液100μL于1.5mL滅菌離心管中;棉拭子直接取100μL提取。
1.2RNA提取
推薦采用RNA提取試劑盒(離心柱提取法),請按照試劑盒說明書進(jìn)行操作。
2.試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設(shè)所需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1管陰性對照+1管陽性對照;樣品每滿7份,多配制1份),每測試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑AIV-H7N9 反應(yīng)液 酶液
用量20μL 1μL
將混合好的測試反應(yīng)液分裝到PCR反應(yīng)管中,21uL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟1提取的RNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取4μL,分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR擴(kuò)增(核酸擴(kuò)增區(qū))
4.1將待檢測反應(yīng)管置于熒光定量PCR 儀反應(yīng)槽內(nèi);
4.2設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為25μL;熒光通道選擇:檢測通道(Reporter Dye)FAM、CY5,淬滅通道(Quencher Dye)選擇NONE,ABI系列儀器請勿選擇ROX參比熒光,選擇None即可。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟循環(huán)數(shù)溫度時間收集熒光信號
1 1cycle 42℃ 20min 否
2 1cycle 95℃ 10min 否
3 40cycle 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.結(jié)果分析判定
5.1結(jié)果分析條件設(shè)定
設(shè)置Baseline和Threshold:一般直接按機(jī)器自動分析的結(jié)果分析,當(dāng)曲線出現(xiàn)整體傾斜時,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)Baseline的start值(一般可在3~15范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、stop 值(一般可在5~20范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及Threshold的Value值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結(jié)果。
5.2結(jié)果判斷
FAM通道為禽流感病毒H7N9亞型H7基因檢測結(jié)果,CY5通道為禽流感病毒
H7N9亞型N9基因檢測結(jié)果
陽性:檢測通道Ct值≤35.0,且曲線有明顯的指數(shù)增長曲線。
可疑:檢測通道Ct值>35.0,且出現(xiàn)明顯擴(kuò)增曲線的樣本建議重復(fù)試驗,重復(fù)試驗結(jié)果出現(xiàn)Ct值≤35.0和明顯擴(kuò)增曲線者為陽性,否則為陰性。
陰性:樣本檢測結(jié)果無Ct值且無明顯的擴(kuò)增曲線。
6.檢測方法的局限性
樣本檢測結(jié)果與樣本收集、處理、運(yùn)送以及保存質(zhì)量有關(guān);
樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結(jié)果;
陽性對照、擴(kuò)增產(chǎn)物泄漏,會導(dǎo)致假陽性結(jié)果;
病原體在流行過程中基因突變、重組,會導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
不同的提取方法存在提取效率差異,會導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
試劑運(yùn)輸,保存不當(dāng)或試劑配制不準(zhǔn)確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定
量檢測不準(zhǔn)確的結(jié)果;
本檢測結(jié)果僅供參考,如須確診請結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測手段。
7.質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性質(zhì)控品:無明顯擴(kuò)增曲線且無Ct值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴(kuò)增曲線有明顯指數(shù)生長期,且Ct值≤32;
以上條件應(yīng)同時滿足,否則實驗視為無效。